El principal efecto en los ecosistemas mesopelágicos y bentónicos sería probablemente una reducción del pH y, en el caso de los organismos que se hallen directamente en la trayectoria del penacho de CO2, el estrés fisiológico causado por una presión parcial elevada de CO2.
ويرجح أن يكون الأثر الرئيسي تقليص نسبة تركيز الهيدروجين بالنسبة للنُظم الإيكولوجية في القيعان والأعماق المتوسطة والتوتر الفيزيولوجي الناجم عن ضغط ثاني أكسيد الكربون الجزئي المرتفع بالنسبة للكائنات التي تتواجد مباشرة في عمود دخان ثاني أكسيد الكربون.